Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LtaP09225 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
LtaP09225 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LtaP09225 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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