Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxa5P09021 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms