Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm20828J3KMI7 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms