Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
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