Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Cldn8Q9Z260 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Cldn8Q9Z260 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Cldn8Q9Z260 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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