Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rnf123Q5XPI3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms