Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL354892.3-201ENST00000586101 1630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CAMK2BQ13554 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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