Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXA9P31269 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HOXA9P31269 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms