Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdzd9Q9D9M4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Pdzd9Q9D9M4 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdzd9Q9D9M4 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms