Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Cnot11Q9CWN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Cnot11Q9CWN7 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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