Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRIM4Q9C037 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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