Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
H2-M10.5Q85ZW7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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H2-M10.5Q85ZW7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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