Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ipo8Q7TMY7 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms