Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKOR2Q2VWA4 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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