Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Cab39Q06138 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.9 ms