Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SIM1P81133 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SIM1P81133 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms