Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccer2J3QPU5 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccer2J3QPU5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms