Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn7aB1AYL1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn7aB1AYL1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Scn7aB1AYL1 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Scn7aB1AYL1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms