Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn2Q9ER65 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn2Q9ER65 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms