Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NsmfQ99NF2 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NsmfQ99NF2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms