Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CCBE1Q6UXH8 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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