Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Usp48Q3V0C5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Usp48Q3V0C5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Usp48Q3V0C5 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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