Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Usp19Q3UJD6 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp19Q3UJD6 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms