Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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Treml4Q3LRV9 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Treml4Q3LRV9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Treml4Q3LRV9 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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