Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPIDRQ14159 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms