Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH18Q13634 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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