Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RIPPLY1Q0D2K3 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms