Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tff2Q03404 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff2Q03404 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tff2Q03404 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tff2Q03404 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tff2Q03404 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Tff2Q03404 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Tff2Q03404 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tff2Q03404 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Tff2Q03404 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Tff2Q03404 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Tff2Q03404 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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