Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ptprn2P80560 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms