Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
RxraP28700 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RxraP28700 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
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