Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Gm28048F7BCN0 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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