Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syce3B5KM66 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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