Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syngr4Q9Z1L2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Syngr4Q9Z1L2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Syngr4Q9Z1L2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms