Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hmg20bQ9Z104 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hmg20bQ9Z104 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hmg20bQ9Z104 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hmg20bQ9Z104 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms