Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH5

Trim10, Tripartite motif-containing protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim10Q9WUH5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim10Q9WUH5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trim10Q9WUH5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trim10Q9WUH5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms