Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vax2Q9WTP9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vax2Q9WTP9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms