Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rfwd2Q9R1A8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rfwd2Q9R1A8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rfwd2Q9R1A8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms