Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0L1

Hsf4, Heat shock factor protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hsf4Q9R0L1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hsf4Q9R0L1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hsf4Q9R0L1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hsf4Q9R0L1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms