Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AmfrQ9R049 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AmfrQ9R049 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AmfrQ9R049 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AmfrQ9R049 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms