Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rad18Q9QXK2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rad18Q9QXK2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rad18Q9QXK2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms