Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA1

Cyhr1, Cysteine and histidine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyhr1Q9QXA1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Cyhr1Q9QXA1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cyhr1Q9QXA1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cyhr1Q9QXA1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cyhr1Q9QXA1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cyhr1Q9QXA1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Cyhr1Q9QXA1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cyhr1Q9QXA1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms