Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Trpc4Q9QUQ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Trpc4Q9QUQ5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Trpc4Q9QUQ5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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