Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC3

Msrb1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb1Q9JLC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msrb1Q9JLC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msrb1Q9JLC3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msrb1Q9JLC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msrb1Q9JLC3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Msrb1Q9JLC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Msrb1Q9JLC3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Msrb1Q9JLC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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