Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Smad9Q9JIW5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smad9Q9JIW5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smad9Q9JIW5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms