Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmbr1Q9JIT0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1Q9JIT0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmbr1Q9JIT0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1Q9JIT0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms