Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI99

Sgpp1, Sphingosine-1-phosphate phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgpp1Q9JI99 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sgpp1Q9JI99 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Sgpp1Q9JI99 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sgpp1Q9JI99 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms