Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tnfrsf13bQ9ET35 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms