Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERY9

Erg28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erg28Q9ERY9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Erg28Q9ERY9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Erg28Q9ERY9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Erg28Q9ERY9 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Erg28Q9ERY9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms