Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
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Ndst3Q9EQH7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ndst3Q9EQH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
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Ndst3Q9EQH7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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Ndst3Q9EQH7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ndst3Q9EQH7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
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