Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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Rnf138rt1Q9D9M9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Rnf138rt1Q9D9M9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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